1040
Подразделение:
Биолого-почвенный факультет
Тема:
Механизмы специализации транспортных рецепторов мРНК (NXF – nuclear export factor) у D.melanogaster
Цель:
Анализ характера экспрессии генов семейства nxf у различных групп животных
Описание:
Какие организмы в генах семейства nxf имеют интрон, разделивший экзо- ны в 110 и 37 п. н., и для каких генов nxf известен транскрипт, содержа- щий кассетный интрон.
Какие последовательности кассетного интрона являются эволюционно кон- сервативными и, следовательно, могут быть функционально значимыми.
Определить структуру альтернативных транскриптов гена nxf1 и охарактеризовать их органоспецифичность.
Какие особенности могут быть свойственны белку, который соответствует транскрипту с кассетным интроном, и отличают такой белок от известного полноразмерного белка NXF1
Эти задачи планируется решить при помощи методов биоинформатики, а именно: сборки транскриптомов и "reference-assisted" сборки геномов на базе открытых данных РНК и ДНК секвенирования
Руководитель:
Мамон Людмила Андреевна
E-mail руководителя:
Дата начала работ:
2014-01-01
Дата окончания работ:
2014-12-31
Количество ВМ:
1
ОС ВМ:
L
Вычислительные системы:
ВМ
Статус:
ЗАВЕРШЕНА